Група дослідників під керівництвом мікробіолога-еколога Цічао Ту з Шаньдунського університету виявила у прибережних зонах Китаю велике різноманіття гігантських вірусів, частина з яких не належить до жодної відомої родини. Результати дослідження опубліковані в журналі Nature Communications.
Як проводилося дослідження?
Дослідники зібрали близько 200 зразків мулу з припливних мілин уздовж китайського узбережжя і проаналізували більше 5 терабайт генетичних даних. В результаті вони отримали 237 великих вірусних геномів.
Унікальні характеристики вірусів
Деякі з виявлених геномів містили сотні тисяч фрагментів ДНК — обсяг, який порівнянний з генетичним матеріалом деяких живих клітин.
Нова група вірусів
Аналіз показав, що виявлені віруси поділилися на дві основні групи:
- Приблизно дві третини належать до гігантських вірусів, які заражають одноклітинні організми, включаючи водорості та амеби.
- Решта виявилися гігантськими фагами — вірусами, які вражають бактерії.
Під час побудови еволюційних дерев дослідники виявили нову групу вірусів. Вісім геномів не збігалися ні з однією з відомих вірусних родин.
Зв’язок з членистоногими
Сім представників цієї групи мали генетичний зв’язок з членистоногими — комахами, крабами та креветками. Раніше гігантські віруси переважно пов’язували з мікроскопічними організмами.
Стабільний вірус з Ціндао
Окремо вчені вивчили гігантський фаг з геномом довжиною близько 229 тисяч фрагментів ДНК. Його виявили у всіх зразках з району портового міста Ціндао, незалежно від сезону та глибини взяття проб. Геноми цього вірусу збігалися більш ніж на 99,9%, що вказує на високий рівень стабільності для вірусної популяції.
Роль вірусів у екосистемах
Дослідники також виявили у багатьох вірусів гени, пов’язані з переробкою вуглецю, азоту та амінокислот. Вчені вважають, що такі мікроорганізми могут брати участь у хімічних процесах прибережних екосистем.
Водночас поки що немає підтвердження, що ці гени активуються під час зараження. Автори дослідження зазначають, що нові дані можуть вимагати перегляду існуючих уявлень про кругообіг речовин у прибережних зонах з урахуванням ролі вірусів.